关于 Nextstrain
Nextstrain 是一个开源项目，旨在利用病原体基因组数据的科学和公共卫生潜力。 我们提供对公开可用数据的持续更新视图，并配备强大的分析和可视化功能，展示病原体进化和疫情传播。 我们的目标是帮助理解流行病学并改善疫情应对。
相关数据和推断可在网站 nextstrain.org 实时获取。
关于 Augur
定义：通过预兆预测事件的人。
Augur 是我们用于从序列和血清学数据追踪进化的生物信息学工具包。 它提供了一系列命令，旨在组合成更大的处理流水线。
augur 的输出是一系列 JSON，可用于使用 Auspice 可视化您的结果。
快速入门
按照说明安装 Augur。 通过 完成 Zika 教程 尝试分析真实的病毒数据。
文档
引用
Huddleston J, Hadfield J, Sibley TR, Lee J, Fay K, Ilcisin M, Harkins E, Bedford T, Neher RA, Hodcroft EB, (2021). Augur: a bioinformatics toolkit for phylogenetic analyses of human pathogens. Journal of Open Source Software, 6(57), 2906, https://doi.org/10.21105/joss.02906
其他格式，请参阅 CITATION.cff。
许可证与版权
Copyright 2014-2022 Trevor Bedford and Richard Neher.
Nextstrain 的源代码根据 GNU Affero General Public License (AGPL) 的条款提供。Nextstrain 的发布旨在使其有用，但没有任何保证；甚至没有对适销性或特定用途适用性的隐含保证。 有关更多详细信息，请参阅 GNU Affero General Public License。