"数据流变量在并发编程中具有惊人的表达能力"
Henri E. Bal , Jennifer G. Steiner , Andrew S. Tanenbaum

Nextflow 是一个用于创建可扩展、可移植且可复现工作流的系统。它基于数据流编程模型，极大地简化了并行和分布式管道的编写，使您能够专注于数据和计算的流动。Nextflow 可以在多种执行平台上部署工作流，包括您的本地机器、HPC 调度器、AWS Batch、Azure Batch、Google Cloud Batch 以及 Kubernetes。此外，它还支持多种管理软件依赖的方式，包括 Conda、Spack、Docker、Podman、Singularity 等。

Nextflow 由 Seqera 用心 ❤️ 打造，是运行 Nextflow 的最佳场所。

快速入门

使用一条命令安装 Nextflow：

curl -fsSL https://get.nextflow.io | bash

它会在当前目录中创建 nextflow 可执行文件。然后，您可以将其移动到您 $PATH 中的某个目录，以便从任何位置运行它。

Nextflow 也可以从 Bioconda 安装：

conda install -c bioconda nextflow

文档

Nextflow 文档适用于最新的 稳定版 和 边缘版 发布。

社区

您可以在 Nextflow 社区论坛 或 Nextflow Slack 中提问并获取帮助。Bug 和功能请求应作为 GitHub issues 报告。

Nextflow 社区非常活跃，定期举办社区会议、活动、播客等。您可以在 Nextflow 和 nf-core YouTube 频道上查看这些材料中的大部分内容。

nf-core 项目是一项社区努力，汇集了高质量的 Nextflow 工作流，可供所有人使用。

贡献

我们非常欢迎贡献。详情请参阅 CONTRIBUTING 文件。

许可证

Nextflow 根据 Apache 2.0 许可证发布。Nextflow 是 注册商标。

引用

如果您在工作中使用了 Nextflow，请引用：

P. Di Tommaso, et al. Nextflow enables reproducible computational workflows. Nature Biotechnology 35, 316–319 (2017) doi:10.1038/nbt.3820

致谢

Nextflow 基于两个 *出色的* 开源软件项目构建，Groovy 和 GPars。

YourKit 慷慨地通过其功能齐全的 Java Profiler 支持 Nextflow。